Fr. Marinko Sakota nació en Citluk el 12 de julio de 1968. En esta misma población asistió a la escuela primaria, así como durante el primer grado de la escuela secundaria.
En ese tiempo sintió la vocación y decidió unirse a la orden franciscana, por lo que se trasladó al Seminario Franciscano de Visoko, donde finalizó el segundo grado. Los otros dos los llevó a cabo en el Liceo Jesuita de Dubrovnik, donde terminó el Bachillerato.
Tomó el hábito franciscano el 15 de julio de 1987 en Humac, permaneciendo en el noviciado durante un año. Comenzó sus estudios de Filosofía y Teología en Sarajevo, en la Facultad Franciscana de Teología (1989 -1990); continuó sus estudios en Zagreb, en la Escuela Superior Jesuita (1990-1992) y se licenció en el año 1995 en Fulda, Alemania.
Hizo sus votos perpetuos en Široki Brijeg en 1993. Fue ordenado diácono en Zagreb el 10 de febrero de 1996, y ordenado sacerdote en Frohnleiten el 13 de julio del mismo año. Su primer servicio fue en 1996, en el Monasterio Franciscano de Innsbruck, donde pasó un año como ayudante, de 1996 a1997; posteriormente, fue asistente espiritual en Frohnleiten hasta 1998, y capellán en Augsburgo de 1998 a 2000. Ejerció como capellán de Mostar durante tres años (2000-2003), y posteriormente como párroco en Gradnici durante siete años.
Desde septiembre de 2010 sirvió como capellán de Medjugorje y tras la muerte del P. Petar Vlasic, en 2013, el P. Marinko Šakota es el nuevo párroco de la Parroquia de Santiago Apóstol de Medjugorje.
